Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DDB1Q16531 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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DDB1Q16531 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
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DDB1Q16531 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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DDB1Q16531 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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DDB1Q16531 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DDB1Q16531 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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