Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
USF2Q15853 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
USF2Q15853 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms