Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNHIT3Q15649 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms