Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PUM3Q15397 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUM3Q15397 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms