Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NCF4Q15080 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms