Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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LAPTM4AQ15012 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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LAPTM4AQ15012 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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LAPTM4AQ15012 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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LAPTM4AQ15012 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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