Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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