Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms