Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SPIDRQ14159 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SPIDRQ14159 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SPIDRQ14159 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SPIDRQ14159 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SPIDRQ14159 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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SPIDRQ14159 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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SPIDRQ14159 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SPIDRQ14159 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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SPIDRQ14159 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SPIDRQ14159 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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