Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL4A6Q14031 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms