Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ITGA9Q13797 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGA9Q13797 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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