Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HTR4Q13639 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HTR4Q13639 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HTR4Q13639 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HTR4Q13639 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HTR4Q13639 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HTR4Q13639 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HTR4Q13639 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HTR4Q13639 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HTR4Q13639 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HTR4Q13639 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HTR4Q13639 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HTR4Q13639 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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