Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH18Q13634 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms