Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNW1Q13573 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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