Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NME3Q13232 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NME3Q13232 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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