Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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IFT88Q13099 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFT88Q13099 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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