Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.9 ms