Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CDH17Q12864 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CDH17Q12864 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CDH17Q12864 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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