Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NFIAQ12857 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFIAQ12857 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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