Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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