Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFFO1Q0D2I5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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