Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms