Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms