Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms