Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms