Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDR2Q01850 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms