Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms