Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms