Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBSQ01459 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms