Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms