Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MDM2Q00987 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms