Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IRF9Q00978 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms