Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms