Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX1P83916 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX1P83916 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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