Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMF1P82094 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMF1P82094 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMF1P82094 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMF1P82094 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMF1P82094 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMF1P82094 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMF1P82094 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMF1P82094 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TMF1P82094 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMF1P82094 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMF1P82094 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMF1P82094 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMF1P82094 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMF1P82094 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms