Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIM1P81133 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIM1P81133 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIM1P81133 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SIM1P81133 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIM1P81133 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SIM1P81133 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SIM1P81133 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SIM1P81133 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIM1P81133 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIM1P81133 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIM1P81133 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIM1P81133 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIM1P81133 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms