Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ACTBP60709 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ACTBP60709 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ACTBP60709 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ACTBP60709 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ACTBP60709 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ACTBP60709 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ACTBP60709 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ACTBP60709 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ACTBP60709 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ACTBP60709 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ACTBP60709 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ACTBP60709 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ACTBP60709 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ACTBP60709 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ACTBP60709 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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