Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LINC01547P58512 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms