Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CABP4P57796 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CABP4P57796 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CABP4P57796 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CABP4P57796 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CABP4P57796 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CABP4P57796 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CABP4P57796 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CABP4P57796 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CABP4P57796 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CABP4P57796 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms