Protein–RNA interactions for Protein: P55347

PKNOX1, Homeobox protein PKNOX1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1P55347 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKNOX1P55347 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKNOX1P55347 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKNOX1P55347 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms