Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GEMP55040 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GEMP55040 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GEMP55040 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEMP55040 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms