Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHB1P54762 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.1 ms