Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
POLR2KP53803 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms