Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPAP53621 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPAP53621 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPAP53621 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPAP53621 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPAP53621 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPAP53621 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPAP53621 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPAP53621 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPAP53621 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPAP53621 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms