Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSRP3P50461 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSRP3P50461 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms