Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC1A6P48664 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC1A6P48664 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A6P48664 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A6P48664 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A6P48664 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A6P48664 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A6P48664 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A6P48664 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A6P48664 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A6P48664 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A6P48664 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A6P48664 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A6P48664 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC1A6P48664 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms