Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLCP48506 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLCP48506 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLCP48506 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCLCP48506 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCLCP48506 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCLCP48506 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms