Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms