Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RECQLP46063 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RECQLP46063 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RECQLP46063 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms