Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RANGAP1P46060 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms